丽水市林业科学研究院成立于1975年，2008年“所”改“院”。市林科院下设办公室和森林与环境、食用菌、果树、竹类、中药材等5个专业研究所。现有正式员工28人，其中林业教授级高级工程师9人、高级工程师10人，博士5人，硕士15人。其中，省“151”人才培养工程第一层次1人、省“151”人才第三层次5人、市拔尖人才3人、省突贡专家1人、市突贡专家2人、市首席专家3人、市“138”人才第一层次4人、市“138”人才第二层次3人、市绿谷新秀3人等。
　　丽水市林业科学研究院拥有丽水市处州林业珍贵种苗有限公司和省级重点林木良种基地1500亩，建有全国林业科普基地百果园、浙江省丽水食用菌技术创新服务平台栽培技术研发中心、丽水中药产业科技创新服务平台种质资源研究中心，设有浙江农林大学、中南林业科技大学研究生工作站和丽水市博士工作站，是省级企业博士后工作站试点单位、丽水市中药材重点科技创新团队牵头单位，综合实力在省内地市级林业科研院所中遥遥领先，在全国地市级林业科研机构中走在前列。
市林科院三获中国梁希林业科学技术奖
　　2016年，丽水市林业科学研究院（以下简称为“市林科院”）主持完成“两种生态高效林菌共育模式关键技术”成果获得国家梁希林业科学技术奖三等奖。“多花黄精种质资源收集评价及林下高效栽培技术研究”成果获得省科技进步奖二等奖，“黄甜竹方竹合江方竹3种笋用竹关键栽培技术研究与推广”成果获得省科技进步奖三等奖，得到国内同行的肯定。“多花黄精优良种源初筛及黄精露酒的研制”和“浙西南特色乡土观赏植物品种选育与示范”成果获得市科技兴林一等奖。“浙南山区大型真菌资源调查与开发利用”和“灵芝高效栽培关键技术生产示范与推广”获得市科技进步二等奖。2016年是历年来获省部级奖项最多的一年。“多花黄精种苗繁育技术推广示范”项目得到中央财政林业科技推广示范资金资助，省重点项目“浙西南美丽林相改造关键技术研究与示范”立项，国家环保部生物多样性蝴蝶观测项目（浙江天目山样区）获批。新增主持成果获得各类科技奖励8项，其中梁希林业科技三等奖1项、省科学技术进步二等奖1项与三等奖1项、市科技进步二等奖2项、市科技兴林一等奖2项、市科技进步三等奖1项。新增科技项目19项，合同经费450万元；新增发明专利4项，实用新型专利7项；起草地方标准2个；出版专著4部，发表论文15篇，在一级期刊发表论文4篇，SCI收录1篇。
市林科院新增市级以上人才荣誉称号4个
　　2016年，市林科院新增市级以上人才荣誉称号4个。采用“师傅带徒弟”的形式，组建油茶香榧等人才帮带产业团队7个，创新了基层林业科技推广和人才培养模式，深受基层林业技术人员好评。各团队成员先后进村入基地520余次、解决技术问题117个、开专题讲课123次、培训人数9015人次、发放资料数15218份、师徒对接次数245次、发表论文78篇、职称晋升18人。